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出典: WINGpro
WINGpro（データベースポータルサイト）へようこそ。ライフサイエンス分野のデータベースについての情報が収集、整理、分類されており、現在のところ約557件に及ぶ記事が存在します。ディレクトリからは、データベースの構築法による分類と生物種および対象による分類でデータベースを一覧できます。
2007年7月2日より、ユーザである皆様が記事を投稿および編集できる機能を公開しました。新規データベースに関する記事の投稿、既登録データベース関しても利用方法やTipsに関する追記をしていただけます。なお、投稿・編集のためには、アカウント作成を行い、メール認証を経る必要があります。また、本サイトの基本方針を理解し、承諾いただいた上で記事の投稿・編集をお願いします。今後も、より多くの方々に利用いただき、内容の充実に参加いただけるよう整備を続けていく予定です。 ナビゲーションのヘルプから投稿、編集の方法を掲載しているページを案内しています。
- 新規ページの作成方法に図を加え、分かりやすくしました。
- 画像:WINGproニュースレター Vol1.pdf 新しい記事の作成を掲載しました。
- 画像:WINGproニュースレター Vol2.pdf 記事の編集を掲載しました。
2008年1月より、WINGproの利用法が統合TVで紹介されました。
本サイトは文部科学省「ライフサイエンス分野の統合データベース整備事業平成18年度」の受託業務の一環として運営されています。
秀逸な記事より
Aaindex
| URL | http://www.genome.jp/aaindex/ | ||
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| 提供機関 | 京都大学化学研究所 | | |
| 提供様式 | Webアプリケーションによる検索および結果の閲覧. FTPによるダウンロード | ||
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| 概要 | AAindexは、タンパク質を構成する要素としてのアミノ酸の様々な特徴を、数値で表現したデータを収集したデータベース。AAindex1, AAindex2, AAindex3の３つのデータベースから構成されている。AAindex1は、アミノ酸の物理化学的特性や生物学的特性を表現した 20 の数値セットのデータベース、AAindex2は、アミノ酸置換マトリクスのデータベース、AAindex3は、アミノ酸ペアポテンシャルのデータベースである。 | ||
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| 生物種 | |||
新着記事より
TRNADB-CE
| URL | http://trna.nagahama-i-bio.ac.jp/ | ||
|---|---|---|---|
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| 提供機関 | 長浜バイオ大学 | | |
| 提供様式 | Webインターフェースによる検索および結果の閲覧.ダウンロード.無料. | ||
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| 概要 | tRNA gene database curated manually by experts
ゲノムシークエンシングが完了している細菌と古細菌からそれぞれ28,448、2,096のtRNA遺伝子、さらにWhole genome Shotgunシークエンシングデータから20,975、環境メタゲノムデータから92,542のtRNA遺伝子を収録している。３種類のプログラムを利用しているが、これらの不一致データについて専門家がチェックをしている。マップ表示はKEGG DAS。 | ||
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| 生物種 | |||
ライフサイエンス統合データベース基盤整備
文部科学省「ライフサイエンス分野の統合データベース整備事業 平成18年度」の受託業務の中のポータルサイト構築とは
内閣府連携施策群「ライフサイエンス分野のデータベースの統合化に関する調査研究」旧サイトにおいて作成された国内外のデータベース網羅リスト(データベース一覧(構築型分類 簡略版)、データベース一覧(構築型分類 完全版)） および(独)科学技術振興機構(JST)において作成提供しているデータベースポータルサイトWINGの詳細な内容説明を基礎に、わかりやすく分類され、また、ライフサイエンスの各分野での利用に応じた説明がついた網羅性の高いデータベースのカタログを作成し、さらにJSTで整理を進めてきた解析ツールなどのWebリソースポータルを統合することで多様な利用者を目的にかなったデータベースやリソースに誘導するポータルサイトを構築することです。なお、Webリソースポータルサイトとしては文献に記述された実験方法の索引付けに従った索引と統合するテスト版を公開しています。
